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Main Title: Adaptation of E. coli towards tryptophan analog usage
Translated Title: Adaptation von E. coli zur Verwendung von Tryptophan-Analogen
Author(s): Oehm, Stefan
Referee(s): Budisa, Nediljko
Mutzel, Rupert
Granting Institution: Technische Universität Berlin
Type: Doctoral Thesis
Language Code: en
Abstract: The presented study set out to change the amino acid set of the genetic code in two different Trp-auxotrophic E. coli strains with the help of the serial transfer regime under constant evolutionary pressure. By increasing the stringency of the system as the source for the canonical amino acid is depleted, the bacteria were forced to incorporate the Trp surrogate [3,2]Tpa at all Trp-positions in the proteome. Both evolvates of the ancestral strains MT0 and TUB00 are capable of surviving the Trp to [3,2]Tpa replacement, but still show a preference for their canonical substrate.
Die vorliegende Arbeit befasste sich mit der Veränderung des Aminosäurerepertoires des genetischen Codes innerhalb zwei verschiedener Trp-auxotropher E. coli Stämme mit Hilfe einer seriellen Übertragungsstrategie unter ständigem evolutionären Druck. Durch Erhöhung der Stringenz des Systems durch Entziehung der kanonischen Aminosäure wurden die Stämme gezwungen, das Trp-Analog [3,2]Tpa an allen Trp-Positionen im Proteom einzubauen. Beide Evolvate der Ausgangstämme MT0 und TUB00 können den Trp zu [3,2]Tpa Austausch überleben, zeigen jedoch immer noch Präferenz für das kanonische Substrat.
URI: http://depositonce.tu-berlin.de/handle/11303/6045
http://dx.doi.org/10.14279/depositonce-5629
Exam Date: 11-Jul-2016
Issue Date: 2016
Date Available: 15-Dec-2016
DDC Class: DDC::500 Naturwissenschaften und Mathematik::570 Biowissenschaften; Biologie::576 Genetik und Evolution
Subject(s): experimental evolution
serial long term evolution
xenobiology
tryptophan
biocontainment
experimentelle Evolution
serielle Langzeitkultivierung
Xenobiologie
Tryptophan
biologische Eindämmung
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