Functional Genome Analysis of Mycobacterium tuberculosis

Rachman, Helmy

Functional Genome Analysis of Mycobacterium tuberculosis

dc.contributor.advisor	Kaufmann, Stefan H.E.	en
dc.contributor.author	Rachman, Helmy	en
dc.contributor.grantor	Technische Universität Berlin, Fakultät III - Prozesswissenschaften	en
dc.date.accepted	2003-11-12
dc.date.accessioned	2015-11-20T15:26:58Z
dc.date.available	2004-04-13T12:00:00Z
dc.date.issued	2004-04-13
dc.date.submitted	2004-04-13
dc.description.abstract	Anhand filterbasierter DNA-Arrays, die sämtliche offenen Leseraster von Mycobacterium tuberculosis repräsentieren, wurde eine funktionelle Genom-Analyse des Erregers der Tuberkulose durch geführt. Ein Genom-Vergleich von Mitgliedern des M. tuberculosis-Komplexes wies zusätzlich zu den bekannten Deletionen weitere, bislang unbekannte Sequenzvariationen nach. Der in dieser Arbeit gefundene Sequenzpolymorphismus kann möglicherweise zur Differenzierung der untersuchten Stämme herangezogen werden. Mit denselben DNA-Arrays wurden weitere Transkriptom-Analysen der Genexpressionsprofile von M. tuberculosis durchgeführt, die aus Makrophagen und Gewebematerial der menschlichen Lunge isoliert worden waren. Die DNA-Array-Untersuchungen zeigten ein charakteristisches Muster von aktiver Abgrenzung gegen und Evasion von Wirtsabwehrmechanismen. Die während der Infektion aufregulierten Gene stellen potentielle Zielstruktur für neue Interventionsstrategien dar.	de
dc.description.abstract	By means of filter-based DNA arrays, which represent all open reading frames of Mycobacterium tuberculosis the functional genome analysis of the causative agent of tuberculosis was performed. The genome comparison of the members of M. tuberculosis complex revealed some so far-unknown sequence variations in addition to the known deletions. The sequence polymorphisms, which was observed in this study may be used to differentiate the analysed strains. Using the same DNA arrays the transcriptome analyses of gene expression profile of M. tuberculosis was performed, which was isolated from macrophages and human lung tissue material. The DNA array experiments revealed a characteristic pattern of active fortification against and evasion from host defense mechanisms. The genes which are upregulated during infection represent potential targets for novel intervention strategies.	en
dc.identifier.uri	urn:nbn:de:kobv:83-opus-5991
dc.identifier.uri	https://depositonce.tu-berlin.de/handle/11303/995
dc.identifier.uri	http://dx.doi.org/10.14279/depositonce-698
dc.language	English	en
dc.language.iso	en	en
dc.rights.uri	http://rightsstatements.org/vocab/InC/1.0/	en
dc.subject.ddc	570 Biowissenschaften; Biologie	en
dc.subject.other	DNA-Arrays	de
dc.subject.other	Genomvergleich	de
dc.subject.other	Mycobacterium tuberculosis	de
dc.subject.other	Transkriptom	de
dc.subject.other	Tuberculosis	de
dc.subject.other	DNA arrays	en
dc.subject.other	Genome comparison	en
dc.subject.other	Mycobacterium tuberculosis	en
dc.subject.other	Transcriptome	en
dc.subject.other	Tuberculosis	en
dc.title	Functional Genome Analysis of Mycobacterium tuberculosis	en
dc.title.translated	Funktionelle Genomanalyse von Mycobacterium tuberculosis	de
dc.type	Doctoral Thesis	en
dc.type.version	publishedVersion	en
tub.accessrights.dnb	free	*
tub.affiliation	Fak. 3 Prozesswissenschaften	de
tub.affiliation.faculty	Fak. 3 Prozesswissenschaften	de
tub.identifier.opus3	599
tub.identifier.opus4	605
tub.publisher.universityorinstitution	Technische Universität Berlin	en

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